Dr.MirrorはFTPミラーサイトを効率的に運用できる自動ダウンロードシステムです。
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Dr.Mirrorは、FTPミラーサイトを効率的に運用できる自動ダウンロードシステムです。 |
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複数ファイルを同時にダウンロードすることにより、高速なダウンロードが可能です。
TCP/IPレベルでのFTP状態監視やファイルサイズチェックにより、ダウンロードされたデータの高信頼性が確保できます。
回線断などの不測の事態が発生した場合でも、自動的にリトライを開始します。 また、ファイルセットの中で正常にダウンロードされたものはそのままで、エラーが発生したファイルから処理が再開されますので、 効率的なダウンロードが可能になります。
BioINTEGRA(別売)と組み合わせることで、常に最新のデータベースを検索できる環境を構築することができます。
以下の条件設定にしたがって、自動ダウンロードを実行します
@ ダウンロード元/先パス名(サイト名)
A anonymousパスワード
B 実行開始時刻・間隔(Daily, Weekly, Monthly)
C リトライ回数・間隔
D 同時接続数
E ダウンロードスケジュール有効/無効
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Internetの性質(QoSの低下、ベストエフォート)を考慮したTCP/IPレベルでの制御が可能な“FTPモジュール”を実装しています。 |
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自動ダウンロード条件を設定できます |
| ダウンロード状況(実行中/成功/失敗/更新中)を確認できます。 | |
| ダウンロード履歴を確認できます。 |

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自動ダウンロードが完了した時点で、後処理プログラム(formatdbなど)を自動実行し、BLAST検索に利用できる状態になります |
| No. | DB名 | Dr.Mirror | BioINTEGRAとの連携 |
| 1 | nr-nt | ||
| 2 | nr-aa | ||
| 3 | blastdb | ||
| 4 | genbank | ||
| 5 | genbank-daily | ||
| 6 | refseq | ||
| 7 | refseq-daily | ||
| 8 | dbSNP | ||
| 9 | UniProtKB/TrEMBL | ||
| 10 | UniProtKB/Swiss-Prot | ||
| 11 | pfam | ||
| 12 | PDB | ||
| 13 | pir | ||
| 14 | dbEST | − | |
| 15 | TAXONOMY | − | |
| 16 | Unigene | Opt. | Opt. |
| 17 | OMIM | Opt. | − |
| 18 | prosite | Opt. | − |
| 19 | LocusLink | Opt. | − |
| 20 | enzyme | Opt. | − |
現在サポートしている公共データベースを以下に示します。 ⇒その他のデータベースに関してはお気軽にお問い合わせください。
| OS | RedHat Linux(IA-32) |
| CPU | PentiumV以上を推奨 |
| メモリ | 512MB以上を推奨 |
| HDD | 32GB以上(OS+本S/Wのみ、データベース含まず)を推奨 |
| Webブラウザ | Netscape 6以上、Internet Explorer 5.5以上 |