SISNIPERは特定の遺伝子だけでなく、遺伝子ファミリー内の特異的ノックダウンや共通配列の選択にも利用できます。
ファミリ遺伝子に対するsiRNA配列の設計
特定の遺伝子だけでなく、あるファミリー遺伝子に対して共通に作用するsiRNA配列の設計や、特異的遺伝子にだけ作用するsiRNA配列の設計に利用することができます。